類(lèi)器官是能夠在體外三維培養,并表現出相應器官生物學(xué)特征的“最小系統”。雖然對于類(lèi)器官的研究日趨成熟,但大家總會(huì )有這樣那樣的小困惑:為什么要用上皮細胞培養?為什么培養基的成分這么復雜?
今天小編整理了一些關(guān)于類(lèi)器官構建原理方面的問(wèn)題,希望能夠對各位小伙伴有所幫助。
Q1: 類(lèi)器官培養對于起始細胞的來(lái)源有要求嗎?
A1: 目前培養的類(lèi)器官主要來(lái)源于上皮細胞,對于非上皮細胞來(lái)源的類(lèi)器官培養方式還需要進(jìn)一步研究。
Q2: 類(lèi)器官按照起始細胞的類(lèi)型,分為幾種呢?
A2: 常見(jiàn)的類(lèi)器官根據起始細胞的類(lèi)型,可以分為兩種:
(1)腫瘤組織來(lái)源的腫瘤類(lèi)器官;
(2)干細胞來(lái)源的類(lèi)器官,包括:多能性干細胞 (PSC) /成體干細胞 (ASC)以及誘導多能干細胞(iPSC)。
Q3: 類(lèi)器官是由單一種類(lèi)細胞組成的嗎?
A3: 類(lèi)器官并不是單一細胞組成的結構,而是由具有干細胞性質(zhì)的起始細胞進(jìn)行分裂和分化,并將多種類(lèi)型的細胞自組裝的結構,自組裝后的形態(tài)和功能與體內相應器官相似。
Q4:在沒(méi)有新鮮組織的情況下,可以用凍存組織提取的原代細胞進(jìn)行3D培養嗎?
A4:可以的。已有學(xué)者驗證過(guò),將人結腸癌、甲狀腺癌、肺癌、腎癌和肝癌的手術(shù)組織切碎后,以梯度降溫的方式進(jìn)行冷凍,最終在液氮中保存15-18個(gè)月后進(jìn)行復蘇和原代細胞提取,分別對細胞進(jìn)行2D和3D培養,證實(shí)了凍存對于細胞活力和生長(cháng)速度均無(wú)顯著(zhù)影響【1】。
當然,由于組織來(lái)源不同、凍存條件不同,還需要大家根據實(shí)際情況進(jìn)行驗證,新鮮組織提取的細胞依然是3D培養的最佳選擇。
Q5:類(lèi)器官可以像細胞一樣進(jìn)行凍存和復蘇嗎?
A5:類(lèi)器官可以?xún)龃?,通常?huì )在傳代2-3次之后選擇凍存。為了達到最佳的效果,可以選擇類(lèi)器官成熟(傳代7-10次)后再進(jìn)行凍存。
Q6:類(lèi)器官的尺寸需要進(jìn)行控制嗎?
A6:是的,主要的原因是類(lèi)器官內部缺乏循環(huán)系統。
當類(lèi)器官的尺寸較大時(shí),靠近中心的細胞難以和外界進(jìn)行氧氣和營(yíng)養成分的交換。因此這個(gè)結構尺寸越大,死亡的細胞就越多(如圖1)【2】。我們在培養的過(guò)程中,需要控制類(lèi)器官的大小在4-5mm以?xún)?。未?lái)的類(lèi)器官技術(shù)可以與血管類(lèi)器官結合在一起,建立一個(gè)功能性的封閉循環(huán)系統,用以培養出更大尺寸的類(lèi)器官。
圖1. TUNEL染色表明較大尺寸的類(lèi)器官中心有大量細胞死亡(綠色),比例尺為100μm【2】
Q7:類(lèi)器官傳代的標準是什么?
A7:類(lèi)器官的傳代通常是根據培養的時(shí)間判斷。一般在7-14天時(shí)進(jìn)行第一次傳代,后續則每7-10天傳代一次【3】。
Q8:類(lèi)器官可以進(jìn)行多少次傳代?
A8:大部分類(lèi)器官可以在體外連續傳代10次(>6個(gè)月),甚至有些類(lèi)器官可以連續傳代20次(>12個(gè)月)并且維持原有的生長(cháng)速度【4】。
Q9: 鑒定類(lèi)器官的方法有哪些?
A9: 初步可以通過(guò)顯微鏡和H&E染色觀(guān)察形態(tài);然后可以用Western Blot、qRT-PCR、免疫熒光、流式細胞術(shù)檢測該類(lèi)器官是否表達相應的biomarker;基因測序可以鑒定所培養的類(lèi)器官是否有某些特征丟失;對于部分類(lèi)器官,還可以檢測其是否具有功能,例如:已有研究檢測出胃類(lèi)器官可以分泌胃酸,心臟類(lèi)器官可以自主跳動(dòng)。
Q10: 類(lèi)器官是如何按照我們的意愿進(jìn)行定向分化的?
A10: 在進(jìn)行類(lèi)器官培養前,我們需要了解該器官在體內的發(fā)育過(guò)程,及早期發(fā)育相關(guān)的信號通路。
以胃類(lèi)器官培養為例:胃由前后腸發(fā)育而來(lái),早期發(fā)育需要由多種信號通路共同調控。那么在體外我們需要通過(guò)添加細胞因子的方式,指導激活/抑制相應的信號通路,來(lái)達到相同的效果,如:PSCs在A(yíng)ctivin A的作用下分化為內胚層,Wnt3a、FGF-4和Noggin指導細胞向向前腸分化【5】。
類(lèi)器官是能夠在體外三維培養,并表現出相應器官生物學(xué)特征的“最小系統”。隨著(zhù)類(lèi)器官培養技術(shù)的不斷進(jìn)步,應用也越來(lái)越廣泛。
今天小編整理了一些關(guān)于類(lèi)器官應用方面的問(wèn)題,希望能夠對各位小伙伴有所幫助。
Q1:用于疾病研究的類(lèi)器官需要最大限度減小差異。但在實(shí)際培養過(guò)程中,同批次類(lèi)器官個(gè)體之間、以及不同批次類(lèi)器官樣本之間均存在顯著(zhù)差異,這個(gè)問(wèn)題怎樣克服呢?
A1: 類(lèi)器官是由不同類(lèi)型的細胞組成的結構,并且在體外是自組裝的,因此很容易存在同一樣本在相同培養條件下的孔間差異。
如果是用于患者個(gè)性化醫療的腫瘤類(lèi)器官,需要更精準地模擬患者體內的特征,這種情況建議采用多個(gè)平行來(lái)減小差異;
如果是用于機制研究或用作疾病模型的類(lèi)器官,可以考慮利用“微流控液滴技術(shù)”進(jìn)行工程化培養,相關(guān)成果已發(fā)表在Cell Reports Medicine【1】。
Q2: 目前培養出的類(lèi)器官可以進(jìn)行體內移植,用于器官重建嗎?
A2:已有動(dòng)物實(shí)驗證實(shí)過(guò)可行性,比如:腸類(lèi)器官移植小鼠治療潰瘍性結腸炎【2】;胰島類(lèi)器官移植小鼠治療糖尿病【3】。
雖然目前類(lèi)器官移植尚未進(jìn)入臨床,但在2021年2月,Science【4】首次報道了利用膽道類(lèi)器官修復離體條件下的人類(lèi)肝臟,實(shí)現了膽道再生,并改善了膽汁性質(zhì)。
Q3:類(lèi)器官一般長(cháng)到什么程度可以用來(lái)進(jìn)行藥物測試?
A3:這個(gè)問(wèn)題可以在Nature Protocols【5】找到答案。
對于新鮮培養的類(lèi)器官:建議對低代次類(lèi)器官(2-3代)進(jìn)行藥物篩選,以最大限度地減少使用過(guò)的培養基或體外突變累積對藥物測試的影響。
對于經(jīng)過(guò)凍存的類(lèi)器官:由于冷凍/解凍可能導致復蘇時(shí)器官樣形態(tài)的變化,因此建議類(lèi)器官至少傳代一次再進(jìn)行藥物篩選。如果出現復蘇后細胞活力不佳,則需要延長(cháng)培養時(shí)間以恢復細胞狀態(tài)。
Q4:類(lèi)器官建立是否成功有怎樣的標準嗎?
A4:1、判斷形態(tài)。顯微鏡下類(lèi)器官形態(tài)可能為空泡狀、出芽狀、緊密型、松散型等,但整體形態(tài)一致。
2、可以鑒定相應的biomarker是否有表達,及分布是否與組織切片相似。
3、是否能夠傳代3次以上,并可以?xún)龃鎻吞K。
4、如果有條件的話(huà),可以進(jìn)行測序分析。
Q5:類(lèi)器官可以進(jìn)行基因編輯嗎?
A5:可以,干細胞來(lái)源類(lèi)器官的基因編輯多用于疾病建模,而腫瘤來(lái)源的類(lèi)器官則多用于尋找疾病相關(guān)突變點(diǎn)或治療靶點(diǎn),圖1列舉了類(lèi)器官基因編輯的部分研究和應用。
圖1.類(lèi)器官基因編輯的部分研究和應用【6】
Q6:類(lèi)器官培養和普通細胞培養有何不同之處?
A6:1、細胞來(lái)源有區別:類(lèi)器官的細胞來(lái)源是具有多能性的上皮細胞,而普通細胞培養適用于培養多種類(lèi)型細胞;
2、 細胞培養方式不同:1)類(lèi)器官需要基質(zhì)膠等材料支撐其三維結構,普通細胞培養則不需要;2) 類(lèi)器官需要實(shí)現體外分化和自組裝,因此需要多種細胞因子的組合進(jìn)行誘導,培養基成分復雜。而普通細胞培養通常為單一種類(lèi)細胞,因此培養基成分較簡(jiǎn)單;
Q7:用哪種培養基培養來(lái)自轉移部位腫瘤的類(lèi)器官,比如原發(fā)灶為A類(lèi)型腫瘤,轉移灶為B類(lèi)型腫瘤?
A7:通常來(lái)講,如果腫瘤發(fā)生了轉移,我們依然選用相對應的原發(fā)灶(A類(lèi)型)PDO培養基。
Q8:怎樣證明培養出的結構是類(lèi)器官,而不是簡(jiǎn)單聚集在一起的細胞團?
A8:類(lèi)器官的分化方式本質(zhì)上是在模擬體內的器官發(fā)育,因此表達形態(tài)及各細胞分布情況與實(shí)際器官具有相似性,而細胞團則沒(méi)有這種規律。我們可以通過(guò)免疫熒光的方式檢測biomarkers的分布情況來(lái)區分。例如下圖中的結果表明,腎類(lèi)器官與腎組織的biomarkers分布高度一致【7】。
圖2. 腎類(lèi)器官與腎組織的biomarkers分布高度一致【7】
Q9:類(lèi)器官的的來(lái)源細胞必須要具有多能性嗎?正常組織成熟體細胞可以進(jìn)行類(lèi)器官培養嗎?
A9:由于類(lèi)器官涉及到體外分化和自組裝,因此來(lái)源細胞必須具有多能性。正常組織的成熟體細胞中往往會(huì )有一部分成體干細胞(標志物為L(cháng)gr5,CD133等),這部分細胞也可以進(jìn)行類(lèi)器官培養。
Q10:可以通過(guò)構建條件性培養基代替商品化的細胞因子嗎?
A10:依據Hans Clevers實(shí)驗室早期發(fā)表的文章,可以采用條件性培養基代替純化的細胞因子進(jìn)行類(lèi)器官培養,但同時(shí)也需要考慮條件性培養基的不足之處。小編總結了條件性培養基和近岸細胞因子的參數差異。
表1. 條件性培養基和近岸蛋白細胞因子的參數差異
總的來(lái)說(shuō),條件性培養基對于部分預實(shí)驗或少量類(lèi)器官培養是可行的,但鑒于質(zhì)粒構建和驗證消耗的時(shí)間,以及檢測過(guò)程涉及的抗體、qPCR等成本也是需要考慮在內的。同時(shí),細胞代謝產(chǎn)物、內毒素和宿主殘留物等也有可能影響實(shí)驗結果。因此,選用高品質(zhì)的商品化細胞因子能夠幫您節約時(shí)間和金錢(qián)成本,快速推動(dòng)類(lèi)器官培養進(jìn)程。
類(lèi)器官是能夠在體外三維培養,并表現出相應器官生物學(xué)特征的“最小系統”。雖然許多類(lèi)器官的培養方案日漸成熟,但在實(shí)際操作中總會(huì )碰到這樣那樣的問(wèn)題。
今天小編整理了一些類(lèi)器官培養操作中常遇到的問(wèn)題,希望能夠對各位小伙伴有所幫助。
Q1: 按照文獻方法進(jìn)行類(lèi)器官培養,為什么觀(guān)察到的形態(tài)卻和文獻不一致?
A1:決定類(lèi)器官形態(tài)的因素有很多,樣本來(lái)源是否相同、選用的細胞因子品質(zhì)是否有差異都有可能改變最終的類(lèi)器官形態(tài)。這里舉一個(gè)文獻中的例子,分別取四個(gè)高級別漿液性(HGS)卵巢癌患者的腫瘤組織,用同樣的條件進(jìn)行類(lèi)器官培養,H&E染色結果顯示它們的形態(tài)千差萬(wàn)別【1】。因此對于類(lèi)器官的鑒定,我們不能局限于形態(tài)觀(guān)察,需要使用多種方法相結合。
圖1. 由4例HGS卵巢癌患者的腫瘤組織所制備的類(lèi)器官形態(tài)不同【1】
Q2:類(lèi)器官的藥敏實(shí)驗中需要使用DMSO作為藥物的溶劑,需要控制DMSO的用量嗎?
A2:考慮到DMSO這類(lèi)有機物的細胞毒性,建議終濃度不超過(guò)0.1%(v/v)。
Q3:培養過(guò)程中發(fā)現類(lèi)器官培養物中有黑色小顆粒,這個(gè)是雜質(zhì)嗎?應該怎樣去除?
A3:黑色小顆粒大概率是雜質(zhì)或細胞碎片,去除它們有以下兩種方式可以參考:
1、將類(lèi)器官消化下來(lái),用培養基進(jìn)行反復清洗,達到稀釋雜質(zhì)的作用;
2、用無(wú)菌手術(shù)刀將類(lèi)器官切成兩半,取1ml注射器吸滿(mǎn)培養基并輕輕推出,沖洗類(lèi)器官中的雜質(zhì)【2】。
Q4:對于腫瘤患者的個(gè)性化醫療測試,PDO、PDX、PDXO的模型可以相互結合使用嗎?
A4:PDO、PDX、PDXO模型有各自的優(yōu)勢,通常有以下兩種結合方式:PDO-PDX和PDX-PDXO。
1、PDO-PDX是性?xún)r(jià)比更高的方式,即:先利用PDO進(jìn)行高通量的藥物篩選,篩選出有效的藥物再進(jìn)行PDX測試。
2、PDX-PDXO是更精準的藥物測試方式,即:先利用PDX產(chǎn)生大量的體內腫瘤,然后將這些腫瘤分離進(jìn)行PDXO培養,此時(shí)可以通過(guò)PDX模型,將PDXO的藥敏實(shí)驗結果與體內用藥結果一一對應,進(jìn)而預測人體用藥的結果,實(shí)現對患者更精準的用藥指導;并且可以用PDX模型將轉移后的腫瘤分離,同樣進(jìn)行PDXO培養和用藥,能夠更精確地對轉移灶進(jìn)行藥物篩選。
Q5:類(lèi)器官怎么從基質(zhì)膠中回收?
A5:1、將類(lèi)器官放置在冰上,待基質(zhì)膠融化后離心進(jìn)行回收,這種方式適用于不需要將類(lèi)器官結構完全打散的情況;
2、市售的細胞回收液,可以溫和有效地獲得細胞懸液,不會(huì )損傷細胞或細胞表面蛋白。
Q6:為什么用基質(zhì)膠來(lái)培養類(lèi)器官?可以用其它類(lèi)型的凝膠替代嗎?
A6:基質(zhì)膠能夠為類(lèi)器官提供支撐作用,目前類(lèi)器官培養用的基質(zhì)膠來(lái)源于小鼠肉瘤的基底膜基質(zhì),其中含有約60%層粘連蛋白、30% IV 膠原和8%的巢蛋白,還含有基底膜聚糖、TGF-?、表皮生長(cháng)因子、類(lèi)胰島素生長(cháng)因子、組織纖溶酶原等1800多種獨特的蛋白質(zhì)。由于基質(zhì)膠中各因子的不確定性,并且存在批次間差異,因此目前也有一些聚焦于基質(zhì)膠替代方案的研究,如圖2【3】。
圖2.基質(zhì)膠的三種替代方案【3】。(a)去細胞外基質(zhì)和其他衍生蛋白質(zhì),(b)合成水凝膠,以及(c)工程重組蛋白凝膠
Q7:怎樣確定某一種類(lèi)器官的培養方式更適用于基質(zhì)膠包埋法還是氣-液交互法呢?
A7:1、根據所模擬的器官自身生長(cháng)情況選擇,例如:皮膚的正常生長(cháng)是有一面需要接觸空氣,那么對于皮膚類(lèi)器官的培養傾向于利用氣-液交互法來(lái)培養【4】;
2、考慮所培養的類(lèi)器官模型的應用方向,例如:氣-液交互法培養易于進(jìn)行病毒感染實(shí)驗,因此用于病毒感染實(shí)驗的氣道類(lèi)器官會(huì )優(yōu)先選擇氣-液交互法培養【5】。
Q8:在進(jìn)行藥敏實(shí)驗前,類(lèi)器官的接種方式是怎樣的呢?
A8:藥物篩選前,通常將類(lèi)器官吹散后,用含2%-5%基質(zhì)膠的培養基懸浮,并最終鋪在基質(zhì)膠包被的孔板中【6-7】。
Q9:在離心回收時(shí),會(huì )有很多類(lèi)器官粘附在離心管壁,有沒(méi)有更好的辦法提高回收率?
A9:建議采用水平轉子代替角轉子,可以有效減少類(lèi)器官掛在離心管壁的情況。
Q10:利用腫瘤類(lèi)器官模型進(jìn)行篩選的藥物有什么局限性嗎?
A10:1、抗體藥物因為需要免疫細胞的參與,因此腫瘤類(lèi)器官不能篩選抗體類(lèi)藥物,此類(lèi)藥物篩選需要構建腫瘤類(lèi)器官-腫瘤微環(huán)境的模型來(lái)實(shí)現;
2、由于腫瘤類(lèi)器官中沒(méi)有對血管進(jìn)行培養,因此抗血管類(lèi)的藥物也同樣不能進(jìn)行篩選。
近岸蛋白自主研發(fā)生產(chǎn)的低內毒素Activin A、FGF系列、HGF、R-Spondin 1、Noggin和Wnt3a等細胞因子,內毒素低至<10EU/mg,具有高活性、高純度、高批間一致性,為類(lèi)器官培養設計,已獲得市場(chǎng)認可,讓您研究放心!
目錄號 | 產(chǎn)品名稱(chēng) |
Human/Mouse/Rat Activin A | |
Human/Mouse/Rat BDNF | |
Human/Mouse/Rat BMP-2 | |
Human DKK1 (N-8His) | |
Human EGF | |
Mouse EGF (C-6His) | |
Human FGF basic/FGF-2 | |
Mouse FGF basic/FGF-2 | |
Human FGF-4 | |
Mouse FGF-4 | |
Human FGF-7/KGF | |
Human FGF-9 | |
Mouse FGF-9 (N-6His) | |
Human FGF-10 | |
Human FGF-19 | |
Human GDNF | |
Human HGF (C-6His) | |
Mouse HGF (C-6His) | |
Human LIF | |
Mouse LIF | |
Human Noggin | |
Mouse Noggin(C-6His) | |
Human NRG1-beta 1 | |
Human NT-3 | |
Human OSM (N-6His) | |
Human Prolactin/PRL | |
Human R-Spondin 1 (C-6His) | |
Human R-spondin 3 (C-6His) | |
Human Shh | |
Human Shh (C24II) | |
Mouse Shh | |
Mouse Shh(C25II) | |
Human TGF-beta 1 | |
Human Wnt3a | |
Human Wnt3a V2 |
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